学科竞赛、第二课堂成绩突出；学校承担了多项国家级、省级课题研究，以理论指导教育教学实践。作为“江苏省体育传统项目学校（羽毛球专项）”，2004年该校羽毛球队代表中国参加了世界中学生羽毛球锦标赛，获女子团体冠军和男子团体亚军。
12中初中部是江苏省体育传统项目学校（羽毛球专项）；12中初中部与南京新东方学校结成战略联盟，成为南京新东方英语实验基地，并采用新东方教学模式、新东方教学理念、新东方优能测试体系、走名高课程、励志教育、未来设计、金牌老师等资源，从今年初一新生开始在姜家园校区免费开设新东方英语实验班。
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