南京南站地铁站是南京地区重要的交通枢纽之一，(也是重要的交通换乘枢纽，经过南京南站地铁站的线路分别是 南京地铁1号线，南京地铁3号线，南京地铁S1号线(机场线)，南京地铁S3号线(宁和城际)，南京地铁6号线，南京地铁12号线)，附近有 清阁小炒，AIGLE艾高南京南站店，南京南站和谐网咖，南京忠明之家旅馆 等，满足您的衣食住行需要。
9号口 通向南京南站北广场西侧;
10号口 通向高铁南站北广场东侧;
12号口 通向六朝路。
| 线路 | 首班车 | 末班车 | 首班车 | 末班车 |
|---|---|---|---|---|
| 南京地铁1号线 | 往 迈皋桥 方向 | 往 中国药科大学 方向 | ||
| 05:42 | 23:19 | 05:47 | 23:27 | |
| 南京地铁3号线 | 往 林场 方向 | 往 秣周东路 方向 | ||
| 06:00 | 23:00 | 06:00 | 23:00 | |
| 南京地铁S1号线(机场线) | 往 南京南站 方向 | 往 空港新城江宁 方向 | ||
| 06:00 | 22:40 | 05:57 | 22:40 | |
| 南京地铁S3号线(宁和城际) | 往 高家冲 方向 | 往 南京南站 方向 | ||
| 06:00 | 22:00 | 06:00 | 23:00 | |
| 南京地铁6号线 | 往 新生圩 方向 | 往 禄口机场 方向 | ||
| 00:00 | 00:00 | 00:00 | 00:00 | |
| 南京地铁12号线 | 往 黄里 方向 | 往 南京南站 方向 | ||
| 00:00 | 00:00 | 00:00 | 00:00 | |
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